Fatih Eken'in cenazesi, morgdan alınarak Maltepe Tugay Yolu Merkez Camii'ne getirildi. Cenaze namazına; Eken'in eşi, annesi, yakınları, THY Genel Müdürü Temel Kotil ve çok sayıda arkadaşı katıldı. Namaz öncesi Eken'in yakınları ve arkadaşları uzun süre gözyaşı döktü. Temel Kotil'de acılı Eken ailesine taziyelerini iletti.
Cenaze namazının ardından Eken'in naşı Kozlu Mezarlığı'nda toprağa verildi.